要注意的是，蓮子心具有較低的毒性，不是普通食品。2008年，原衛生部（現在的衛生和計劃生育委員會）曾在回復函中稱，‘蓮心含有多種生物活性物質，在我國缺乏單獨作為食品原料的使用歷史和食用安全證明。’
因此，蓮子心很少被直接食用，更常被作為一種‘藥’使用。
日常的開水沖泡，很難使蓮子心中的生物堿發揮活性作用，所以作為日常飲品飲用是可以的，只是很難有明顯的保健效果。而從安全性考慮，不推薦經常直接食用。
氣候炎熱時，那些平素身體強壯的人（陽盛的人），常會出現鼻干、咽痛、目赤等上火的情況，這時如果要用蓮子煲糖水，蓮子就不需去芯。
患更年期綜合癥的婦女一般既有氣血虧虛，又有心肝火盛，因此藥食治療時，也常建議選用帶心的蓮子。
小孩子心肝火盛，經常容易煩躁，這種情況可以用蓮子（留芯）煮湯給他們服食，因為蓮子芯能清心除煩，蓮子肉則能使他們的脾胃健運，這是一種清而不傷的方法。
